Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-EP13747 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms