Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR2F1P10589 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR2F1P10589 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR2F1P10589 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NR2F1P10589 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR2F1P10589 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR2F1P10589 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR2F1P10589 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR2F1P10589 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms