Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms