Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP10P09238 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP10P09238 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP10P09238 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MMP10P09238 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP10P09238 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP10P09238 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP10P09238 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP10P09238 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP10P09238 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP10P09238 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP10P09238 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP10P09238 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP10P09238 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP10P09238 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP10P09238 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP10P09238 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP10P09238 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP10P09238 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP10P09238 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP10P09238 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP10P09238 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP10P09238 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP10P09238 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP10P09238 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP10P09238 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms