Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NGFRP08138 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NGFRP08138 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NGFRP08138 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NGFRP08138 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms