Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMBP08118 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMBP08118 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMBP08118 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMBP08118 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMBP08118 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMBP08118 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMBP08118 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMBP08118 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMBP08118 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMBP08118 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMBP08118 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMBP08118 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMBP08118 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMBP08118 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMBP08118 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMBP08118 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMBP08118 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMBP08118 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMBP08118 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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MSMBP08118 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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MSMBP08118 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMBP08118 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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MSMBP08118 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMBP08118 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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MSMBP08118 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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MSMBP08118 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMBP08118 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMBP08118 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMBP08118 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMBP08118 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMBP08118 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMBP08118 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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MSMBP08118 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMBP08118 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMBP08118 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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MSMBP08118 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSMBP08118 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSMBP08118 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSMBP08118 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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MSMBP08118 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSMBP08118 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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MSMBP08118 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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MSMBP08118 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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MSMBP08118 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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MSMBP08118 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSMBP08118 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSMBP08118 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSMBP08118 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MSMBP08118 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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