Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms