Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGF1P05230 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FGF1P05230 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FGF1P05230 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FGF1P05230 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FGF1P05230 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FGF1P05230 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FGF1P05230 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FGF1P05230 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FGF1P05230 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FGF1P05230 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FGF1P05230 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FGF1P05230 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FGF1P05230 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
FGF1P05230 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FGF1P05230 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGF1P05230 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms