Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IFNA4P05014 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
IFNA4P05014 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFNA4P05014 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFNA4P05014 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFNA4P05014 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFNA4P05014 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFNA4P05014 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IFNA4P05014 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFNA4P05014 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFNA4P05014 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IFNA4P05014 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNA4P05014 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms