Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOEP02649 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOEP02649 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOEP02649 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOEP02649 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOEP02649 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOEP02649 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOEP02649 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOEP02649 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOEP02649 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOEP02649 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOEP02649 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOEP02649 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOEP02649 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOEP02649 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOEP02649 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOEP02649 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms