Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTAP01374 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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LTAP01374 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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LTAP01374 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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LTAP01374 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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LTAP01374 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTAP01374 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTAP01374 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTAP01374 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTAP01374 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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