Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX58O95786 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX58O95786 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX58O95786 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX58O95786 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX58O95786 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX58O95786 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX58O95786 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX58O95786 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX58O95786 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX58O95786 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX58O95786 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX58O95786 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms