Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POP4O95707 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POP4O95707 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POP4O95707 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POP4O95707 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POP4O95707 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POP4O95707 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POP4O95707 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POP4O95707 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POP4O95707 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POP4O95707 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POP4O95707 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms