Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms