Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVILO95425 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SVILO95425 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SVILO95425 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SVILO95425 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
SVILO95425 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SVILO95425 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVILO95425 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVILO95425 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVILO95425 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVILO95425 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVILO95425 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVILO95425 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVILO95425 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVILO95425 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVILO95425 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVILO95425 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVILO95425 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVILO95425 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVILO95425 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVILO95425 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVILO95425 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVILO95425 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVILO95425 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVILO95425 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVILO95425 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVILO95425 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms