Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP9O75884 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms