Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRMUO75648 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRMUO75648 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms