Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PITX3O75364 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PITX3O75364 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PITX3O75364 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PITX3O75364 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PITX3O75364 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PITX3O75364 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PITX3O75364 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PITX3O75364 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PITX3O75364 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PITX3O75364 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PITX3O75364 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PITX3O75364 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PITX3O75364 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX3O75364 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX3O75364 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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