Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms