Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms