Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms