Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNMO15061 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNMO15061 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNMO15061 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNMO15061 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNMO15061 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNMO15061 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNMO15061 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNMO15061 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNMO15061 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNMO15061 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNMO15061 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNMO15061 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNMO15061 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNMO15061 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNMO15061 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNMO15061 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNMO15061 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNMO15061 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNMO15061 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNMO15061 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNMO15061 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNMO15061 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNMO15061 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNMO15061 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNMO15061 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNMO15061 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNMO15061 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNMO15061 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNMO15061 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNMO15061 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNMO15061 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNMO15061 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNMO15061 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNMO15061 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNMO15061 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNMO15061 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNMO15061 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNMO15061 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNMO15061 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNMO15061 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNMO15061 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNMO15061 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNMO15061 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNMO15061 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNMO15061 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNMO15061 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNMO15061 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNMO15061 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNMO15061 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNMO15061 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNMO15061 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNMO15061 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNMO15061 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNMO15061 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNMO15061 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNMO15061 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNMO15061 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNMO15061 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNMO15061 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNMO15061 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNMO15061 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNMO15061 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNMO15061 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNMO15061 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNMO15061 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNMO15061 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNMO15061 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNMO15061 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNMO15061 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNMO15061 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNMO15061 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNMO15061 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNMO15061 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNMO15061 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNMO15061 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNMO15061 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNMO15061 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNMO15061 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNMO15061 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNMO15061 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNMO15061 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNMO15061 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNMO15061 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNMO15061 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNMO15061 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNMO15061 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNMO15061 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNMO15061 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNMO15061 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms