Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFIT3O14879 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms