Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F3O00716 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F3O00716 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F3O00716 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F3O00716 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F3O00716 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms