Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRPO00591 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRPO00591 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRPO00591 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRPO00591 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRPO00591 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRPO00591 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRPO00591 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRPO00591 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRPO00591 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRPO00591 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRPO00591 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRPO00591 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRPO00591 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRPO00591 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRPO00591 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRPO00591 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRPO00591 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms