Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF839A8K0R7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms