Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms