Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms