Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAI2Q9Y5P3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAI2Q9Y5P3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAI2Q9Y5P3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAI2Q9Y5P3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAI2Q9Y5P3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAI2Q9Y5P3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAI2Q9Y5P3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms