Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KNSTRNQ9Y448 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms