Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms