Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms