Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms