Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms