Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms