Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED23Q9ULK4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms