Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms