Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSEQ9UL01 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms