Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms