Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms