Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms