Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms