Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms