Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms