Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGC1AQ9UBK2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms