Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms