Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms