Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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GDAP2Q9NXN4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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