Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms