Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RLIMQ9NVW2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RLIMQ9NVW2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RLIMQ9NVW2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RLIMQ9NVW2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RLIMQ9NVW2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RLIMQ9NVW2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RLIMQ9NVW2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RLIMQ9NVW2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RLIMQ9NVW2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RLIMQ9NVW2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RLIMQ9NVW2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RLIMQ9NVW2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RLIMQ9NVW2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RLIMQ9NVW2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RLIMQ9NVW2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RLIMQ9NVW2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RLIMQ9NVW2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms